Comment toucher 100 % de son salaire en arrêt maladie : la méthode en trois étages

Oui, il est possible de toucher 100 % de son salaire en arrêt maladie, mais jamais automatiquement : il faut cumuler les indemnités journalières de la Sécurité sociale (50 % du salaire, dans la limite d'un plafond), le complément de l'employeur (90 % puis deux tiers du brut, selon l'ancienneté) et, le plus souvent, une garantie de prévoyance qui comble le reste. C'est la combinaison de ces trois étages qui vous amène à 100 %, et pas l'un d'eux isolément.

Ce que beaucoup de salariés ignorent, c'est que leur convention collective ou leur accord d'entreprise peut prévoir bien mieux que le minimum légal, parfois un maintien intégral dès le premier jour. Encore faut-il le savoir et le réclamer : sans cette vérification, beaucoup encaissent une perte de salaire qu'ils n'auraient pas dû subir.

Dans cet article, on décortique les trois étages de l'indemnisation, les durées selon votre ancienneté, le cas des affections de longue durée (ALD) et la liste des réflexes à avoir si votre arrêt dépasse 3 mois, avec les chiffres en vigueur en 2026.

L'essentiel à retenir

• Les IJ de la Sécurité sociale valent 50 % du salaire journalier de base, plafonnées à 42,97 € brut par jour pour un arrêt débutant depuis juillet 2026 : seules, elles ne remplacent jamais tout votre salaire.
• Le complément employeur légal exige un an d'ancienneté et garantit 90 % du brut pendant 30 jours, puis deux tiers pendant 30 jours, après 7 jours de carence ; ces durées augmentent avec l'ancienneté.
• La prévoyance collective prend le relais quand le complément employeur s'arrête, souvent jusqu'à 100 % du net : c'est le troisième étage.
• En ALD, la Sécurité sociale peut verser les IJ pendant 3 ans au lieu de 360 jours sur 3 ans, mais l'employeur, lui, ne verse pas plus longtemps.
• Vérifiez votre convention collective dès maintenant : c'est elle qui décide si vous touchez 100 % ou non.

Qui paie quoi en arrêt maladie : les trois étages de l'indemnisation

Qui paie le complément de salaire en cas d'arrêt maladie ? Trois acteurs se relaient : la Sécurité sociale verse les indemnités journalières (IJSS), votre employeur ajoute un complément selon votre ancienneté, et la prévoyance comble le reste. C'est ce qu'on appelle un complément de salaire arrêt maladie à trois étages, et comprendre qui verse quoi vous évite de croire à tort que vous avez été sous-payé.

L'étage 1 : les IJSS versées par la CPAM

La Caisse primaire d'assurance maladie additionne vos salaires bruts des trois mois précédant l'arrêt et divise le total par 91,25 : c'est votre salaire journalier de base. L'indemnité journalière en vaut 50 %. Le salaire pris en compte est plafonné à 1,4 Smic, soit 2 613,83 € par mois : l'IJ ne peut donc pas dépasser 42,97 € brut par jour, quel que soit votre salaire (ameli.fr). Elle est versée pour chaque jour calendaire, après un délai de carence de 3 jours (voir notre article sur les jours de carence en arrêt maladie).

Pour un salaire de 2 500 € brut, l'IJ s'élève à 41,10 € brut, soit 38,34 € net après 6,7 % de CSG et de CRDS. Elle est en outre imposable, sauf en ALD (voir les indemnités journalières sont-elles imposables ?).

L'étage 2 : le complément employeur

Avec au moins un an d'ancienneté, votre employeur doit compléter vos IJ, en application des articles L1226-1 et D1226-1 et suivants du Code du travail. Le barème légal : 90 % de votre rémunération brute pendant 30 jours, puis deux tiers pendant 30 jours supplémentaires, IJ déduites. Ce complément démarre au 8e jour d'arrêt (7 jours de carence employeur), et dès le premier jour en cas d'accident du travail.

L'étage 3 : la prévoyance

Quand les deux premiers étages ne suffisent pas, ce qui est presque toujours le cas pour les arrêts longs et pour les salaires au-dessus du plafond, la prévoyance collective intervient pour combler le différentiel. C'est elle qui permet de viser 100 % sur la durée. Nous détaillons son fonctionnement dans notre article sur la prévoyance en arrêt maladie.

La subrogation : pourquoi votre fiche de paie semble bizarre

Un point pratique capital : dans beaucoup d'entreprises, l'employeur est subrogé dans vos droits. Il perçoit les IJSS directement à votre place, puis vous verse votre salaire maintenu. Votre bulletin de paie fait alors apparaître une retenue pour absence, puis le complément et les IJ : le compte peut sembler étrange, mais il est juste. Sans subrogation, vous recevez les IJ de la CPAM d'un côté et le complément employeur de l'autre, souvent avec un décalage de quelques semaines.

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Maintien de salaire arrêt maladie : combien de temps et sous quelles conditions ?

Combien de temps dure le maintien de salaire en arrêt maladie ? Le minimum légal garantit 90 % du brut puis deux tiers, chacun pendant au moins 30 jours, à condition d'avoir au moins un an d'ancienneté et d'être soigné en France ou dans l'Espace économique européen. Les durées augmentent de 10 jours par tranche de 5 ans d'ancienneté au-delà de la première année, et s'apprécient sur 12 mois glissants : les arrêts des 12 derniers mois réduisent les droits restants.

Voici les durées légales selon l'ancienneté :

• 1 à 5 ans — période à 90 % : 30 jours ; puis période aux 2/3 : 30 jours
• 6 à 10 ans — période à 90 % : 40 jours ; puis période aux 2/3 : 40 jours
• 11 à 15 ans — période à 90 % : 50 jours ; puis période aux 2/3 : 50 jours
• 16 à 20 ans — période à 90 % : 60 jours ; puis période aux 2/3 : 60 jours
• 21 à 25 ans — période à 90 % : 70 jours ; puis période aux 2/3 : 70 jours
• 26 à 30 ans — période à 90 % : 80 jours ; puis période aux 2/3 : 80 jours
• 31 ans et plus — période à 90 % : 90 jours ; puis période aux 2/3 : 90 jours

Au-delà, l'employeur ne doit plus rien au titre de la loi. Pour chiffrer votre propre situation jour par jour, utilisez notre calcul des indemnités journalières : il applique ces durées, la carence et le plafond des IJ.

Les conventions collectives plus généreuses : vérifiez la vôtre

Le barème légal n'est qu'un plancher. De nombreuses conventions collectives et accords d'entreprise font mieux : maintien à 100 % du salaire, carence réduite ou supprimée, durées plus longues. Les écarts sont importants d'une branche à l'autre, et même d'une entreprise à l'autre au sein d'une même branche.

Votre convention collective figure sur votre bulletin de paie (intitulé et numéro IDCC) et se consulte gratuitement sur le Code du travail numérique. Avant même de tomber malade, demandez à votre service RH ce que prévoient la convention et l'accord d'entreprise : c'est la question qui détermine si vous toucherez 100 %.

Comment toucher 100 % de son salaire en arrêt maladie ALD ou longue durée

Pour toucher 100 % de son salaire en arrêt maladie ALD ou longue durée, il faut d'abord faire reconnaître votre affection de longue durée par l'Assurance maladie, puis cumuler les trois étages : IJ pendant une durée allongée, complément employeur ou conventionnel, et prévoyance. L'ALD change surtout les règles côté Sécurité sociale, pas côté employeur, et c'est là qu'il faut être vigilant.

Ce que l'ALD change

Les affections de longue durée figurent sur une liste établie par la Sécurité sociale (cancers, diabète, sclérose en plaques, etc.). Si votre médecin traitant fait la demande et que l'Assurance maladie la valide :

• les IJ peuvent être versées pendant 3 ans de date à date, au lieu de 360 jours sur 3 ans pour un arrêt ordinaire (ameli.fr) ;
• le délai de carence de 3 jours ne s'applique qu'au premier arrêt lié à l'ALD sur une période de 3 ans ;
• les IJ liées à une ALD exonérante ne sont pas soumises à l'impôt sur le revenu.

Attention : l'employeur, lui, ne change pas les règles

C'est le piège classique. Votre ALD est reconnue pour 3 ans côté Sécurité sociale, mais votre employeur reste tenu au même barème : 90 % puis deux tiers, puis plus rien. Avec 3 ans d'ancienneté, le complément légal s'arrête au 67e jour d'arrêt. Il ne reste alors que les IJ, et pour un salaire de 4 000 € brut, cela représente environ 1 200 € net par mois contre 3 120 € de net habituel.

C'est donc la prévoyance qui devient indispensable. La plupart des contrats collectifs prévoient une franchise, souvent alignée sur la fin du maintien employeur, puis une indemnisation pouvant atteindre 100 % du net, et une rente si l'arrêt débouche sur une invalidité. Déclarez l'arrêt à l'organisme de prévoyance dès que possible, en respectant le délai fixé par votre notice.

La mutuelle et la prévoyance peuvent-elles verser un complément de salaire ?

Est-ce que la mutuelle peut verser un complément de salaire ? Rarement : la mutuelle (complémentaire santé) rembourse les frais de santé, tandis que c'est le contrat de prévoyance qui verse un complément de salaire en cas d'arrêt de travail. Confondre les deux, c'est l'erreur la plus coûteuse pendant un arrêt. C'est aussi la clé de l'arrêt maladie maintien de salaire à 100 % : sans prévoyance, vous restez au niveau légal de 90 % puis deux tiers, pour une durée limitée.

Mutuelle ≠ prévoyance

Les deux contrats sont souvent souscrits auprès du même organisme et apparaissent l'un sous l'autre sur votre bulletin de paie, d'où la confusion. La mutuelle santé collective, obligatoire dans le privé et financée au moins pour moitié par l'employeur, rembourse consultations, médicaments et hospitalisation. La prévoyance, elle, verse des indemnités journalières complémentaires en cas d'arrêt, une rente en cas d'invalidité et un capital en cas de décès.

Certains contrats individuels de santé incluent une garantie « perte de revenus » en option. Si vous n'avez pas de prévoyance d'entreprise, vérifiez les garanties de vos contrats : elles sont rarement réclamées alors qu'elles existent.

Où trouver la notice et comment déclarer le sinistre

Pour savoir ce qui vous couvre, trois sources, dans cet ordre :

• La DRH ou le service paie, qui doit vous remettre la notice d'information de la prévoyance collective.
• Votre convention collective, disponible sur le Code du travail numérique.
• Votre bulletin de paie, qui affiche une ligne « prévoyance » avec, souvent, le nom de l'organisme.

Ensuite, comment obtenir un complément de salaire en arrêt maladie ? Transmettez votre arrêt à la CPAM et à votre employeur dans les 48 heures, puis déclarez-le à l'organisme de prévoyance dans le délai prévu par la notice. Dans beaucoup d'entreprises, c'est l'employeur qui fait la déclaration et vous reverse les sommes avec le salaire. Conservez une copie de tous les échanges avec l'employeur, la CPAM et l'organisme.

Et pour les indépendants ?

Les travailleurs indépendants n'ont pas d'employeur pour compléter leurs IJ. Ils doivent souscrire une prévoyance individuelle (souvent appelée assurance perte de revenus) qui complète les indemnités de leur régime obligatoire. Pour les micro-entrepreneurs, voir notre article sur l'arrêt maladie de l'auto-entrepreneur.

Lire aussi | Rupture conventionnelle et arrêt maladie : tout ce qu'il faut savoir avant de signer

Arrêt maladie de plus de 3 mois : comment éviter la perte de salaire

Comment ne pas perdre d'argent en arrêt maladie de plus de 3 mois ? En agissant sur trois fronts dès les premières semaines : faire reconnaître l'ALD si le diagnostic le permet, activer la prévoyance avant la fin du maintien employeur, et préparer la reprise, par exemple avec un temps partiel thérapeutique. Passé le complément employeur, sans prévoyance, la chute de revenus est brutale.

Ce que vous perdez réellement : trois exemples chiffrés

Prenons un arrêt continu qui se prolonge au-delà du complément employeur légal (67 jours avec 3 ans d'ancienneté). Il ne reste alors que les IJ, versées pour chaque jour calendaire. Sur un mois de 30 jours, pour un salarié non-cadre :

• Salaire de 1 867 € brut (Smic), environ 1 456 € net : IJ de 30,69 € brut par jour, soit environ 859 € net sur le mois. Vous touchez 59 % de votre net habituel, une perte d'environ 600 €.
• Salaire de 2 500 € brut, environ 1 950 € net : IJ de 41,10 € brut par jour, soit environ 1 150 € net. Là encore 59 % du net habituel, et une perte d'environ 800 € par mois.
• Salaire de 4 000 € brut, environ 3 120 € net : l'IJ est bloquée au plafond de 42,97 € brut, soit environ 1 200 € net. Vous touchez 39 % de votre net habituel et perdez plus de 1 900 € par mois.

Plus votre salaire dépasse le plafond, plus le troisième étage est indispensable. Même pendant le complément employeur, la perte existe : sur un arrêt de 90 jours à 2 500 € brut avec 3 ans d'ancienneté, vous percevez environ 4 430 € net au lieu de 5 770 €.

La liste des réflexes si l'arrêt s'installe

1. Contactez la prévoyance sans attendre : même si votre contrat prévoit une franchise, déclarez l'arrêt dans le délai fixé par la notice.
2. Demandez l'ALD à votre médecin traitant si votre pathologie figure sur la liste : elle sécurise jusqu'à 3 ans d'IJ.
3. Vérifiez la portabilité : en cas de rupture du contrat pendant l'arrêt (licenciement, rupture conventionnelle), vos garanties santé et prévoyance peuvent être maintenues gratuitement jusqu'à 12 mois si vous avez droit au chômage (voir la portabilité de la mutuelle).
4. Préparez la reprise : le temps partiel thérapeutique permet de reprendre progressivement, avec des IJ qui complètent le salaire des heures non travaillées.
5. Contrôlez vos bulletins de paie chaque mois pour vérifier le complément employeur et la déduction des IJ.
6. En cas de refus de la CPAM, saisissez sa commission de recours amiable.

Le mot de la fin : 100 % ne tombe jamais du ciel

Toucher 100 % de son salaire en arrêt maladie n'est jamais automatique. C'est une somme : IJ de la Sécurité sociale + complément employeur + prévoyance. Si un étage manque, vous encaissez la différence. La vraie question n'est donc pas « ai-je droit à 100 % ? » mais « quels sont mes trois étages, et jusqu'où montent-ils chacun ? »

Deux actions à mener dès maintenant, avant même d'en avoir besoin : demandez à votre RH votre convention collective et la notice de prévoyance de l'entreprise, puis comparez-les au minimum légal (90 % puis deux tiers). Le jour où l'arrêt tombe, envoyez-le sous 48 heures à la CPAM et à votre employeur, et déclarez-le à la prévoyance.

Pour savoir précisément ce qui arrivera sur votre compte, simulez votre arrêt avec notre calcul des indemnités journalières : salaire, ancienneté, durée de l'arrêt et maintien conventionnel à 100 %, il détaille le montant période par période.

Sources

• Assurance Maladie : arrêt maladie, indemnités journalières du salarié
• Service-Public.fr : indemnités journalières versées au salarié en arrêt maladie
• Ministère du Travail : l'indemnisation légale des absences pour maladie ou accident

Montants, taux et règles vérifiés le 5 octobre 2026 auprès des sources officielles citées. Les exemples chiffrés sont indicatifs et ne remplacent pas un conseil personnalisé.